La OMS incluye artículos de ITRASIG en su Literatura Global.
La Organización Mundial de la Salud incluye dos artículos
desarrollados en ITRASIG como parte de su Literatura Global para la Enfermedad por
Coronavirus.
De las actividades de investigación realizadas en ITRASIG, se desprenden los
artículos científicos de relevancia en el diagnóstico del SARS-CoV-2, ellos son:
RT-qPCR Assays for Rapid Detection of the N501Y, 69-70del, K417N, and
E484K SARS-CoV-2 Mutations: A Screening Strategy to Identify Variants
With Clinical Impact.
Trabajo que proporciona ensayos de RT-qPCR de bajo costo para la detección rápida y
la vigilancia molecular de mutaciones con un impacto clínico potencial. Esta
estrategia permitió detectar por primera vez la mutación E484K y la variante P.2 en
muestras de población mexicana.
An Upgrade on the Surveillance System of SARS-CoV-2: Deployment of New
Methods for Genetic Inspection.
El cual concluye en qué la detección de mutaciones por RT-qPCR fue totalmente
concordante con los resultados de la NGS; por lo tanto, puede medir con precisión la
incidencia de VOI y VOC, a un menor costo y en menos tiempo en comparación con NGS.
Además, el resultado obtenido con este kit permitió identificar un posible caso
de coinfección, evento difícil de identificar con los datos de NGS y los análisis
bioinformáticos actuales. Finalmente, un análisis de datos NGS más profundo con
FreeBayes vcf file, o un software similar, proporcionará más información sobre las
características genómicas de la población dentro de una muestra, y puede
implementarse en las bases de datos actuales sin demandar una capacidad de
almacenamiento excesiva como se requeriría para archivos fastq o bam.
Nuestros resultados alientan el uso de nuevos métodos validados que pueden
emplearse para una vigilancia genómica amplia y asequible de las variantes del
SARS-CoV-2, y recomiendan un mayor desarrollo de los mismos, especialmente en los
países en desarrollo.